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耳目一新!这篇多层次、多条件的文库筛选,找到了调控 NK 细胞的关键靶点!

作者:admin 浏览量:1 来源:本站 时间:2024-11-15 08:12:55

信息摘要:

NK细胞是肿瘤免疫治疗的关键细胞之一。2025 年 8 月 ,Cancer Cell 期刊发表题为Genome-wide CRISPR screens identify critical targets to enhance CAR-NK cell antitumor potency 的研究论文,通过全基因组 CRISPR 筛选,发现并鉴定了能够增强 CAR-NK 细胞抗肿瘤潜力的关键靶点——MED12、ARIH2 和 CCNC,为开发下一代 NK


NK细胞是肿瘤免疫治疗的关键细胞之一。2025 年 8 月 ,Cancer Cell 期刊发表题为Genome-wide CRISPR screens identify critical targets to enhance CAR-NK cell antitumor potency 的研究论文,通过全基因组 CRISPR 筛选,发现并鉴定了能够增强 CAR-NK 细胞抗肿瘤潜力的关键靶点——MED12、ARIH2 和 CCNC,为开发下一代 NK 细胞疗法提供了宝贵的资源。

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Fig1.构建CRISPR筛选平台,并鉴定PRDM1RUNX3作为NK细胞功能的负调控因子A: 展示了sgRNA递送的病毒载体结构,包含U6启动子、sgRNA scaffold、嘌呤霉素抗性基因和BFP报告基因。B: 实验流程图,说明在两种条件下(有/无饲养细胞;与胰腺癌细胞共培养)进行TF库筛选。C, D: 在两个供体中,筛选出的显著富集或耗竭的TF基因(z-score转换的log2FC),颜色表示在不同筛选条件下的重叠情况。E: PRDM1和RUNX3在不同条件下sgRNA富集情况,显示其在不同压力下的一致性。F: 耗竭基因Reactome通路富集分析,揭示IL和JAK-STAT通路对NK细胞存活至关重要。G: Upset图展示Top 50富集TF在不同筛选条件下的重叠情况,PRDM1和RUNX3在多个条件下重叠。 H: 富集TF通路分析,提示TP53通路可能被靶向,以增强NK功能。I: 单细胞数据验证。PRDM1和RUNX3在胰腺癌患者NK细胞中高表达,与健康人相比有显著差异。

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Fig2.全基因组CRISPR筛选揭示在肿瘤压力下增强NK细胞功能的调控因子,并通过患者的数据验证其临床意义,为后续功能验证提供候选靶点。

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Fig3. 在免疫抑制微环境(TME)压力下的全基因组筛选。

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Fig4. 通过整合多条件筛选数据,提炼出最具转化潜力的共同靶点,为其后续功能验证和机制研究提供依据。

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Fig5.验证MED12作为负调控因子的功能,其缺失能显著提升NK细胞在不同肿瘤模型中的杀伤能力,尤其在与CAR联合时效果更佳。

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Fig6.揭示ARIH2和CCNC通过调控代谢和表型状态协同增强NK细胞功能,双敲效果优于单敲。

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Fig7.双敲ARIH2/CCNC增强CAR-NK细胞的体内疗效,证实双敲策略在体内同样有效,能显著提升NK细胞的浸润、活性和抗肿瘤效果。

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Fig8.ARIH2与CCNC双敲协同增强NK细胞增殖、激活与细胞因子应答。从机制上阐明双敲通过协同调控多个信号通路,将NK细胞重编程为高度激活、代谢适应性强、细胞因子高应答的状态。
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本研究通过多层次、多条件的CRISPR筛选平台,系统性地鉴定了MED12、ARIH2、CCNC等关键负调控因子,并通过体内外功能验证、代谢分析、单细胞测序等手段,阐明其通过调控转录、泛素化、代谢等过程增强NK细胞功能。尤其双敲ARIH2/CCNC表现出显著的协同效应,为下一代CAR-NK细胞的临床转化提供了强有力的候选策略。这项研究不仅填补了人原代NK细胞全基因组筛选的空白,也为克服肿瘤微环境抑制、提升细胞疗法疗效提供了新的理论基础和工程化路径。

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