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转录组测序研究服务合

lncRNA测序简介 长链非编码RNA(longnoncodingRNA,lncRNA)是指长度在200~100000nt之间不具有蛋白编码功能的RNA分子。它们存在带polyA尾和不带polyA尾两种形式,具有跨物种的低保守性,组织特异性表达和丰度低等特点。lncRNA的种类远远超过编码RNA,保守估计哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生ln

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lncRNA测序

简介
       长链非编码RNA(longnoncodingRNA,lncRNA)是指长度在200~100000nt之间不具有蛋白编码功能的RNA分子。它们存在带polyA尾和不带polyA尾两种形式,具有跨物种的低保守性,组织特异性表达和丰度低等特点。lncRNA的种类远远超过编码RNA,保守估计哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生lncRNA转录本,而相应的蛋白编码RNA的比例仅是1%~5%。目前研究提示lncRNA的功能机制主要包括参与转录调控、转录后调控、蛋白质运输和mRNA降解。lncRNA已经成为非编码RNA研究领域的一个热点,借助高通量测序,研究人员能够快速获得与疾病或者特定生物学过程相关的lncRNA并进行深入研究。


流程图

技术优势
       1、信息完善:去rRNA的建库方法,使得一个文库可以同时进行lncRNA和mRNA的分析,节省了实验成本;
       2、准确度高:链特异性建库方法,使得反义lncRNA的鉴定更加准确;
       3、前瞻性好:能发现大量未知的lncRNA信息,适合各类物种的研究;
       4、完整性:获取完整的lncRNA转录信息。
 

smallRNA测序

简介
        smallRNA是生命活动重要的调控因子,在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用,包括miRNA、piRNA和siRNA,晶能生物公司可以提供各类smallRNA的测序服务。
       1、miRNA:是一种长度为21~25nt的单链小分子RNA。它广泛存在于真核生物中,成熟的miRNA是由具发夹结构单链RNA前体(premiRNA)经过Dicer酶加工而成,主要通过与靶标基因不完全互补结合来调控靶基因的表达。miRNA在细胞发育、生物标志物、肿瘤等多个领域中有广泛的应用。
       2、piRNA:是一类长度为26~31nt单链的小RNA,大部分集中在29~30nt。piRNA的表达具有组织特异性,只存在于具有全能性的动物细胞,如生殖细胞、肿瘤细胞和干细胞等。piRNA通过与Piwi亚家族蛋白结合形成piRNA复合物(piRC)来发挥生物学功能(沉默转录基因过程,维持生殖系和干细胞功能,调节翻译和mRNA的稳定性)。此外,piRNA在一些癌症细胞中存在异常表达的现象,提示piRNA可能参与癌症的发生,并可作为癌症诊断和治疗中的潜在生物标记物。
       3、siRNA:内源性干扰小RNA(siRNA,SmallinterferingRNA),包括ta-siRNA、ra-siRNA和nat-siRNA。ta-siRNA:天然反义转录小干扰RNA,由TAS基因编码,miRNA剪切产生,21nt,作用机制类似于miRNA;ra-siRNA:由重复序列、转座子、异染色质产生,多为24nt;nat-siRNA:由天然反义转录本(序列与同区域互补链上基因的mRNA方向相反且发生部分重叠)产生。siRNA的功能主要与植物胁迫和生物发育相关。


流程图

技术优势
       1、完整性好:一次实验可以同时检测多种smallRNA,信息来源于数据库同步;
       2、可靠性强:高数据量保证不同丰度smallRNA都能准确定量;
       3、前瞻性好:能发现未知的smallRNA信息,适合所有物种的研究。
 
 

环状RNA测序

简介
       环状RNA测序是新兴的转录组测序技术。过去普遍认为细胞内的非编码RNA多以线型存在,近年来越来越多的研究发现,环状RNA在哺乳动物细胞内的表达量远高于普遍认识水平。环状RNA可以参与基因的表达调控,例如封闭miRNA的作用、调节本位基因的表达等,是长链非编码RNA研究中的一个新的研究热点。
流程图

技术优势
       1、科学性好:已开发出可靠的环状RNA建库方法和可靠的环状RNA分析流程;
       2、可靠性强:高数据量保证不同丰度环状RNA都能准确鉴定和定量;
       3、前瞻性好:能发现大量新的环状RNA信息,适合多类物种的研究。